「契約書などの重要書類はどうなるのか」

こいつ本当に記者かよ
公益財団法人が解散する時は出資団体で法定年数を管理することに法律で決まってる
組織委の場合はJOCと東京都で50%ずつ出資だから「どっちで保管するの？」って聞きにいけばいいだけや