ロケット団　→ ヤクザ、ポケモン使って金儲けしたい

アクア、マグマ団　→ 環境活動家、伝説のポケモン使って世界を海（陸地）で満たしたい

ギンガ団　→ 表向きは宇宙エネルギー開発企業、伝説のポケモン使って新世界創造したい

プラズマ団　→ 愛護団体、ポケモンを人間から解放したい

フレア団　→ 秘密結社、伝説のポケモン使って人間とポケモンの数を減らしたい

スカル団　→ チンピラ、島めぐりから落ちこぼれたはみだし者の集まり

エーテル財団　→ ポケモン保護団体、裏でウルトラビーストの研究をしている。代表が暴走

エール団　→ フーリガン、マリィを勝たせる為他のジムチャレンジャーを妨害

マクロコスモス　→ 巨大企業、1000年先のエネルギー枯渇問題を解決する為に社長が暴走

スター団　→ 不良集団、学校からいじめっ子を退学させる