「中抜き」は「中間業者を飛ばす」が本来で「中の者が中間マージンを取る」は誤用ですが、2000年の時点での朝日・読売・毎日の記事を見ると、どちらもあります。

らしいわ
マスゴミが誤用し始めたんやな
今はどっちの意味でも使われるからややこしいわマスゴミ死ね
不必要な公共事業に寄生する業者はもっと死ね