大蛇丸はサスケと同じ忍界大戦における功績からの恩赦と司法取引みたいなもんやろ
木の葉側からしたら完全に殺せるか疑問やし敵に回したら厄介やから
監視下に置いて協力関係に置くという判断になったんやろ